Dabartinėje Kongo Demokratinės Respublikos (KDR) teritorijoje seniausi gyventojai buvo pigmėjai, kuriuos vėliau pakeitė bantų gentys, kurios į šią teritoriją ėmė keltis maždaug 2 000 m. pr. Kr. Įvairiais laikotarpiais pro šalies teritoriją migravo įvairios gentys, dėl to iki šiol etninė sudėtis KDR teritorijoje yra margaspalvė.

KDR teritorijoje XIV a. buvo įkurta viena didžiausių Afrikoje Bakongo karalystė. Taip pat gyvavo ir kitos mažesnės valstybės: Lunda, Kazembė, Luba ir kt. XV a. pabaigoje į šią teritoriją ėmė vykti portugalai, daugiausia besiverčiantys vergų prekyba, taip pat dominikonų vienuoliai – misionieriai.

XVIII a. pradžioje įvyko vergų sukilimas prieš europiečius. Dabartinė KDR teritorija formavosi XIX a., kuomet kraštą kolonizavo belgai. Kolonijos vertė dar labiau išaugo, kuomet XIX a. pabaigoje buvo atrastas kaučiukas.

XX a. šalyje ne kartą siautė karai, sukilimai, maištai. 1959 m. prieš kolonistus sukilę vietiniai gyventojai po metų išsikovojo nepriklausomybę. 1971 m. valstybė pervadinta Zairu, o nuo 1997 m. – Kongo Demokratine Respublika.