Automobilių transportas. Atstumai Juodkalnijoje nėra dideli, dėl to patogu keliauti automobiliu, nors nemažai yra siaurų kalnų keliukų. 

Geležinkelių transportas. Geležinkelio linija jungia Juodkalnijos miestą Barą su Serbijos Belgradu. Geležinkelis eina pro Podgoricą, Kolasiną, Mojkovacą ir kitus miestus.

Oro transportas. Juodkalnijoje yra du tarptautiniai oro uostai – Podgorica ir Tivat. Taip pat į Juodkalniją galima atvykti skrendant į Dubrovniko Cilipi oro uostą, kuris yra vos už 16 km nuo Juodkalnijos sienos.