Rusijoje iš šiaurės į pietus nusidriekusios šios gamtinės zonos:

• Arkties dykumų
• Tundros
• Miškatundrės
• Miškų (taigos, mišriųjų ir plačialapių miškų, musoninių miškų)
• Miškastepių ir stepių
• Pusdykumių
• Drėgnųjų subtropikų

Pagal gamtines zonas kinta ir klimatas. Didžiojoje šalies dalyje vyrauja žemyninis, vidutinių platumų klimatas. Žiemą didžioji Rusijos dalis yra atvira šaltoms oro masėms iš šiaurės, dėl to žiemos čia šaltos. Europinėje dalyje sniego danga išsilaiko 5-6 mėnesius, o Sibiro Šiaurėje – ir iki 9 mėnesių per metus.

Šalies šiaurinėje dalyje, Arkties vandenyno salose klimatas arktinis ir subarktinis. Žemiausiai temperatūra nukrenta Rytų Sibire – dažnai net iki -50°C, o kartais ir daugiau. Rytų Sibire, Tolimuosiuose Rytuose yra vadinamoji amžino, arba daugiamečio, įšalo zona.

Juodosios jūros pakrantėje ir Kaukaze vyrauja karštas subtropinis klimatas.