Paragvajus yra tropinio ir subtropinio klimato juostose. Rytiniame Paragvajaus regione vyrauja drėgnas subtropinis klimatas. Vakariniam Paragvajuj būdingas sausas tropinis klimatas.

Išskiriami du pagrindiniai metų laikai. Paragvajuje vasara trunka nuo spalio iki kovo mėnesio, o žiema – nuo gegužės iki rugpjūčio mėnesio.  Tarpiniams mėnesiams, balandžiui ir gegužei, yra būdingos orų permainos. Vasarą vidutinė temperatūra būna +24–27°C, kartais pakyla net iki +40°C. Žiemą temperatūra gali nukristi iki +18–15°C. Šalyje yra tikimybė, kad gali užklupti šalnos ir pasnigti.

Daugiausiai kritulių iškrenta kovo-gegužės ir spalio-lapkričio mėnesiais.